Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTPREP23469 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPREP23469 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTPREP23469 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTPREP23469 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTPREP23469 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTPREP23469 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTPREP23469 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPREP23469 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTPREP23469 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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