Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NTF3P20783 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
NTF3P20783 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NTF3P20783 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NTF3P20783 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NTF3P20783 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NTF3P20783 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NTF3P20783 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NTF3P20783 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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