Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPCAMP16422 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPCAMP16422 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms