Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTLA4P16410 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms