Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD46P15529 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD46P15529 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD46P15529 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD46P15529 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD46P15529 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD46P15529 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD46P15529 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms