Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPCP11686 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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