Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
LAMC1P11047 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMC1P11047 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms