Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TYMSP04818 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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TYMSP04818 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TYMSP04818 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TYMSP04818 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TYMSP04818 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TYMSP04818 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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