Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX7O95931 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX7O95931 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX7O95931 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX7O95931 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX7O95931 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX7O95931 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX7O95931 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms