Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABARAPO95166 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms