Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EBAG9O00559 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms