Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERINC4A6NH21 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC4A6NH21 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms