Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms