Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPDC1A2A3K4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms