Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC12A4Q9UP95 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms