Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms