Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
REREQ9P2R6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REREQ9P2R6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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