Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCM2LQ9NUG4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms