Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSU72Q9NP77 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSU72Q9NP77 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms