Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN28AQ9H9Z2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms