Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C20orf27Q9GZN8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms