Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms