Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTRT3Q9BYD9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms