Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPOQ9BU64 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms