Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PMCHL2Q9BQD1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms