Protein–RNA interactions for Protein: Q99469

STAC, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STACQ99469 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STACQ99469 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STACQ99469 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
STACQ99469 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms