Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A2Q96QD8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms