Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SORCS2Q96PQ0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms