Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDI1Q8WTU0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms