Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF148Q8N7C7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF148Q8N7C7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms