Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG10Q8N0Z9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG10Q8N0Z9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms