Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4L3Q6VB84 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms