Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C16orf54Q6UWD8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms