Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms