Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms