Protein–RNA interactions for Protein: Q1X8D7

LRRC36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC36Q1X8D7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRC36Q1X8D7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRRC36Q1X8D7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms