Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PDK4Q16654 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
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PDK4Q16654 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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