Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GABRA6Q16445 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms