Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F4Q16254 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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