Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms