Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOFQ13790 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOFQ13790 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOFQ13790 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOFQ13790 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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