Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms