Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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CTBP1Q13363 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP1Q13363 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms