Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SKP2Q13309 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP2Q13309 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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