Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PRKAA1Q13131 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRKAA1Q13131 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms