Protein–RNA interactions for Protein: Q12912

LRMP, Lymphoid-restricted membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMPQ12912 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRMPQ12912 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRMPQ12912 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms