Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFRD2Q12894 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms