Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL16A1Q07092 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL16A1Q07092 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms