Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EGR3Q06889 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms