Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OC90Q02509 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OC90Q02509 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OC90Q02509 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OC90Q02509 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OC90Q02509 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OC90Q02509 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OC90Q02509 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OC90Q02509 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OC90Q02509 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OC90Q02509 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OC90Q02509 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OC90Q02509 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OC90Q02509 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms